徐沪济主要致力于风湿性疾病的发病机制研究。他是应用异体 CAR-T 细胞疗法治疗难治性自身免疫性疾病的先驱。他发现了强直性脊柱炎（AS）和类风湿关节炎的关键致病位点，并领导了全球规模最大的强直性脊柱炎基因组学项目，开发出首个基于多基因风险的自身免疫性疾病分子诊断工具。 徐教授已累计领导了 41 项临床试验。在过去十年中，他的研究成果多次发表于《细胞》（Cell）、《自然》（Nature）、《自然·遗传学》（Nature Genetics）、《柳叶刀·风湿病学》（The Lancet Rheumatology）、《关节炎与风湿病学》（Arthritis & Rheumatology）、《风湿病年鉴》（Annals of the Rheumatic Diseases）以及《美国国家科学院院刊》（PNAS）等国际学术期刊。